El 29 de julio de 2016 se cumplieron 50 años de lo que se llamó “La Noche de los Bastones Largos”. Un mes después de producido el golpe militar en contra del entonces presidente Arturo Illia, las fuerzas de la represión decretan la eliminación de la autonomía universitaria e intervienen la Universidad de Buenos Aires (UBA). En esa noche, la fuerza policial, de forma violenta, desaloja la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA. Se dio la represión violenta y detención de profesores, estudiantes y trabajadores de la Universidad. Esta instancia de represión de las ideas produjo una marca indeleble en la investigación y educación en La Argentina, que se profundizó con el posterior golpe militar de 1976 y la conocida “Guerra Sucia”.
Por su participación como defensor del rol de la universidad y los valores de la democracia, y su renuncia a su cargo universitario en oposición a la injerencia militar, el Profesor Minujín en conjunto con otros profesores recibieron reconocimiento por parte del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva así como de la Universidad de Buenos Aires durante una ceremonia celebrada en conmemoración al aniversario de este hecho.